增值税凭证是企业申报增值税的重要凭证，凭借着增值税凭证，企业可以获得代表增值税税额的进项税额，同时也可以将代表销售税额的销售收入抵消掉代表购入税额的进项税额，从而达到减少纳税负担的目的。然而，如果企业逾期申报、开具或使用增值税凭证，可能会引发许多不良后果。

一、申报逾期

若企业未在规定期限内申报增值税，就会面临罚款和滞纳金的处罚。具体地说，企业逾期5天内未申报增值税，则罚款为迟报增值税税额的2%；逾期5天以上未申报增值税，则罚款为500元以上10000元以下，并按日加收滞纳金0.5%。同时，涉及虚开发票、假开发票等情况，还会面临税务机关的行政处罚，包括罚款、吊销营业执照、限制银行贷款等。

二、凭证开具逾期

企业在使用增值税凭证时，需按照税务机关规定的时间、方式开具并提交。如果在规定期限内企业没有开具增值税凭证，则无法享受相应的税收优惠政策，并可能面临税务机关的行政处罚。如企业开具凭证逾期，对于税务机关审核企业所开具的凭证的真实性和合法性也造成了难度，进而可能造成企业缴纳无谓的税款。因此，企业应严格按照税务机关的规定开具增值税凭证，避免出现逾期的情况。

三、凭证使用逾期

企业在用增值税凭证进行申报时，也需遵循税务机关的规定，如未在规定期限内向税务机关交换资料，就有可能被税务机关认定为虚开发票、假开发票等行为，从而受到行政处罚。此外，企业的增值税凭证逾期未使用，会给企业造成会计上的难题，进而无法进行相应的税控操作，而导致所享受的税收优惠政策被取消或削减。

综上所述，企业在进行增值税凭证的申报、开具和使用时，都必须认真遵循税务机关的规定，确保在规定的时间内完成凭证的申报、开具和使用。避免逾期申报、开具或使用增值税凭证所带来的不良后果，既能保障企业在纳税方面的利益，也有助于维护税收秩序和税收公平。